Frekvence dezinfekce stetoskopu závisí na scénáři použití a prostředí:
V běžných ambulancích, pokud se stetoskop používá pouze pro běžné pacienty a není zjevná kontaminace, se doporučuje dezinfikovat jej 1-2krát týdně.
Na odděleních, jako je pediatrie a respirační oddělení, která jsou snadno vystavena infekčním patogenům, nebo ve speciálních prostorách, jako jsou infekční oddělení a jednotky intenzivní péče, by měla být dezinfekce provedena po každém použití.
Pokud je stetoskop používán více různými pacienty v krátkém časovém období, je nejlepší jej dezinfikovat po každém použití, i když je interval krátký.